MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Blattabacterium sp. (Nauphoeta cinerea) plasmid

Total Repeats: 66

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022551	AATTT	2	10	24	33	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022551	TTTA	2	8	42	49	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022551	AAT	2	6	62	67	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022551	ATT	2	6	76	81	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022551	ATT	2	6	94	99	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022551	ATT	2	6	441	446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022551	TAT	2	6	447	452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022551	AAT	2	6	459	464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022551	TGT	2	6	468	473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022551	TAA	2	6	494	499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022551	T	9	9	531	539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022551	ATAC	2	8	540	547	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_022551	AG	3	6	556	561	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022551	ATTC	2	8	570	577	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_022551	G	9	9	606	614	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022551	G	9	9	623	631	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022551	T	9	9	691	699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022551	ATAC	2	8	700	707	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_022551	AG	3	6	716	721	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022551	ATTC	2	8	730	737	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_022551	A	8	8	760	767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022551	A	6	6	790	795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022551	AT	7	14	809	822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022551	AAT	2	6	823	828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022551	A	8	8	831	838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022551	ATTA	2	8	846	853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022551	TTA	2	6	856	861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022551	CG	8	16	885	900	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_022551	A	6	6	916	921	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022551	A	6	6	926	931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022551	A	6	6	937	942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022551	T	9	9	948	956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022551	ATT	2	6	960	965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022551	ATTT	2	8	986	993	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022551	T	6	6	991	996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022551	AAAT	2	8	1007	1014	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022551	A	10	10	1016	1025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022551	A	9	9	2028	2036	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022551	A	6	6	2053	2058	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022551	A	6	6	2060	2065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022551	GGT	2	6	2078	2083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022551	ATAAA	2	10	2107	2116	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022551	TAAAT	2	10	2486	2495	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022551	ATA	2	6	2501	2506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022551	TAA	3	9	2514	2522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022551	A	7	7	2559	2565	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022551	T	8	8	2572	2579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022551	ATTAAT	2	12	2589	2600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022551	A	8	8	2608	2615	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022551	ATA	2	6	2621	2626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022551	ATATT	2	10	2633	2642	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022551	ATA	2	6	2657	2662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022551	A	9	9	3426	3434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022551	AAAAT	2	10	3446	3455	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022551	A	6	6	3468	3473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022551	T	9	9	3477	3485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022551	TGT	2	6	3490	3495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022551	AAT	2	6	3503	3508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022551	T	7	7	3510	3516	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022551	CAT	2	6	3517	3522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_022551	ATG	3	9	3526	3534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022551	ATT	2	6	3546	3551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022551	GAT	2	6	3573	3578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022551	A	6	6	3609	3614	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022551	A	6	6	3622	3627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022551	AGA	2	6	3638	3643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.